综合所得年度自行申报指的是个人在每一年度结束之后，按照规定向主管税务机关申报自己在本年度内的各项所得款项和应纳税额。这些所得款项包括工资薪金所得、劳务所得、经营所得、投资所得、财产租赁所得、知识产权使用费所得等，这些所得都需要缴纳相应的税款。
综合所得年度自行申报制度在我国实施较早，早在个人所得税(初步)实施前夕，我国税务部门就于1980年推出了个人所得税企业代扣代缴的试点工作，经过长期努力基本建立了一个比较成熟的企业代扣代缴的体系。直到现在，我国的综合所得年度自行申报制度已经成为国内最重要的个人所得税征收方式之一。
个人在进行综合所得年度自行申报时，需要按照主管税务机关发布的规定填写个人所得税申报表，对其所得款项和应纳税额进行详细的列示，并交纳应缴税款。为了规范综合所得年度自行申报制度，我国税务部门还对个人申报、税务机关审核、制定税款缴纳计划等数字进行信息化处理，实现了全国联网监控综合所得年度自行申报信息，这些举措进一步加强了综合所得年度自行申报的管理和监督。
综合所得年度自行申报制度是我国个人所得税的一种重要征收方式，它在维护社会公平和税收公正方面具有非常重要的作用。