高通量测序技术（High-throughput sequencing，简称HTS）是基因组学领域的一项核心技术，近年来得到了迅速的发展。该技术可以大大加快基因组DNA序列的测定速度，且更加精准、更加经济高效。
高通量测序技术广泛应用于基因组学、转录组学、表观遗传学和单细胞测序等领域。在基因组学领域，高通量测序技术可以识别基因中的所有变异部分，如单核苷酸多态性（SNP）、插入和删除、基因重复等。此外，该技术还可以帮助研究进行杂交分析和全基因组评估。
在转录组学研究中，高通量测序技术可以对全转录组进行高通量的RNA表达谱测定，从而分析基因表达调控网络，找到不同的组织、器官以及生理状态下的差异表达基因。
在表观遗传学研究中，高通量测序技术可以识别DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质结构的变化，寻找遗传突变造成表观表型变异和表观修饰导致的疾病发生机制。
在单细胞测序领域，高通量测序技术可以对单个细胞进行高通量的基因组、转录组和表观遗传组学测定。单细胞测序技术不仅可以对肿瘤和癌变过程的细胞异质性进行深入研究，也应用于胚胎发育、神经发育和免疫调节等方向的研究。